Например, выпадающее меню находится «позади» флеш-ролика или остается в верхней части наложения лайтбокса.
Попробуйте это # 1
Добавьте это во встраиваемый код Flash:
Попробуйте это # 2
Убедитесь, что элемент, который должен находиться сверху, имеет позиционирование (фиксированное, относительное или абсолютное) и значение z-index выше, чем у объекта Flash.